在甲魚養殖過程中會遇到甲魚常見病，以下介紹幾種甲魚常見疾病的防治。
　　水霉病
　　肉眼可見甲魚四肢、頸部、尾部等處出現水霉，生長緩慢。防治方法：發病后可用魚康寧或用萬分之四小蘇打和萬分之四食鹽合劑全池潑灑，效果很好。
　　脖腫病
　　甲魚脖頸部明顯腫大，口鼻出血，腹甲部呈貧血狀。防治方法：用“鱉健康”治療。
　　紅脖病
　　甲魚脖頸腫脹，腹部充血，身上有紅色斑點，此病為急性傳染病，如防治不及時，會造成甲魚大量死亡。防治方法：定期用生石灰水消毒，保持池水衛生。在飼料中添加1／2000的“鱉健康”，或每千克甲魚用土霉素0.2克拌飼料投喂。10天為一個療程；初期發病的甲魚，每千克可注射青霉素、鏈霉素20萬國際單位于甲魚腹腔，1次~2次即可。
　　腸炎癥
　　甲魚排泄物有異味，消化不暢，行動遲緩。防治方法：在飼料中，添加1%大蒜汁、洋蔥，7天為一個療程。
　　出血病
　　甲魚腹甲出現血斑，腸道和呼吸器官出血，腎臟、肝臟亦呈出血性病變。防治方法：迅速隔離病甲魚，用“鱉健康”或抗生素治療。
　　腐皮病
　　甲魚須、尾、四肢、裙邊出現表皮糜爛現象，嚴重時表皮爛掉、爪脫落、頸部肌肉、骨胳外露。防治方法：除對池水全部用“富氯”、“鱉健康”進行消毒外，將病甲魚迅速隔離，每天用100微升/升磺胺類藥物溶液浸洗2分鐘~5分鐘，1天2次，7天為一個療程，一般可痊愈。
　　感冒病
　　由注入新水水溫過低而引起。造成甲魚一時不適，出現暈頭癥狀。防治方法：每次注入新水要與池水保持相同溫度。如在夏天注入河水，很難與池水溫度一致的情況下，只有加大注水地面流程，促使河水逐步升溫，縮小溫差。